三是要处理好机关党务工作与业务工作的关系。
机关党支部书记一般身兼两职，既是机关部门行政、业务工作的负责人，也是机关党支部日常工作的主持人。这就要求机关党支部书记必须扮演好两种角色、挑起两副担子、负起两种责任。由于机关工作和机关党务工作是“一肩挑”，容易出现“一头沉”，往往沉到业务工作上，重视抓业务工作，忽视抓党务工作；容易出现“一锅煮”，往往党务、业务不分；容易出现“一言堂”，什么事都由领导说了算。
处理好机关党务工作与机关业务工作的关系，必须充分看到二者是统一的，不是对立的。做好党务工作能够有力地促进业务工作。业务工作是靠人来做的，只有从人的思想入手，做好人的思想政治工作，才能牵住“牛鼻子”，更好地做好业务工作。因此，合格的机关党支部书记，不仅是业务工作的行家，也是党务工作的行家。
机关党支部书记是机关党支部工作的第一责任人，要增强“务党”意识，明确党务工作抓什么、怎么抓，达到什么样的目标要求。
一是抓班子自身建设。
以能力建设、先进性和纯洁性建设为主线，加强支部班子的思想、组织、作风、反腐倡廉和制度建设，努力建设创造力凝聚力战斗力强、能够团结带领机关人员圆满完成各项任务的党支部班子。
二是抓思想政治建设。
坚持把思想政治建设摆在各项建设的首位，始终在思想上、政治上、行动上与党中央保持高度一致，在实际工作中确保不发生政治性问题。
三是抓党委决策的执行。
机关是党委的办事机构，机关行政负责人是对行政领导负责，党政负责人对党委负责。机关党支部要抓好党委决策在机关的贯彻执行。
四是抓党员教育管理。
做好机关党支部工作，必须建设高素质的党员队伍。抓好党员的教育管理是建设高素质党员队伍的基本方法。主要是管好党员的思想、学习、工作和生活，也包括八小时以外的“生活圈”“社交圈”“娱乐圈”的管理。
五是抓单位风气建设。
风气正，大家集中精力干工作，出成绩、出干部；风气不正，勾心斗角，产生内耗，影响工作，创不了一流。党支部书记要带头遵守纪律，带头讲原则，带头按规定办事，为充分发挥机关党支部的领导作用创造良好环境。
四是要处理好机关党支部工作规范化与机关党支部工作科学化的关系。
机关党支部工作在实践中形成了一整套程序和方法，具有很强的规范性。只有按照规范程序和方法办事，才能提高机关党支部工作科学化水平，避免和减少工作失误。如评功评奖，要按照群众民主推荐、支委会集体研究，按照少数服从多数的原则形成决议，然后报上级党委审批。如果不按照程序处理，就可能产生这样那样的问题。机关党支部成员要熟悉和掌握党支部经常性工作的程序与方法。主要有：成立(改选)支部委员会、增补支部委员、召开支部委员会和支部党员大会、发展党员、支部委员会报告工作、支部民主生活会、民主评议党员以及处分违纪党员等工作的程序与方法。
