中国共产党新乡市牧野区纪律检查委员会机关与新乡市牧野区监察委员会合署办公，共有15个内设机构，分别为：办公室、组织部、宣传部、信访室、案件监督管理室、案件审理室、党风政风监督室、第一纪检监察室至第七纪检监察室、纪检监察干部监督室。下属1个事业单位：中共牧野区纪律检查委员会教育培训中心(牧野区监察委员会谈话场所管理中心）。

实行统一管理的派驻机构10个，分别为：牧野区纪委监委驻区委办纪检监察组、牧野区纪委监委驻区政府办纪检监察组、牧野区纪委监委驻区人大机关纪检监察组、牧野区纪委监委驻区市场监督管理局纪检监察组、牧野区纪委监委驻区卫生健康委员会纪检监察组、牧野区纪委监委驻区教育体育局纪检监察组、牧野区纪委监委驻区城市管理局纪检监察组、牧野区纪委监委驻区工业和信息化局纪检监察组、牧野区纪委监委驻区财政局纪检监察组、牧野区纪委监委驻区委政法委纪检监察组。